Apuração do caso começou com o depoimento do deputado Luis Miranda na CPI da Covid. A Polícia Federal decidiu abrir inquérito para investigar se Jair Bolsonaro prevaricou em casos de suspeitas de compra da vacina covaxin contra a covid-19. A abertura do inquérito foi autorizada pela ministra Rosa Weber, do STF (Supremo Tribunal Federal), após pedido da PGR (Procuradoria-Geral da República).

A suspeita surgiu após denúncia do deputado Luis Miranda (DEM-DF) em seu depoimento na CPI da Covid. Na ocasião, o parlamentar diz que alertou o presidente sobre possíveis irregularidades na aquisição dos imunizantes e na pressõ que seu irmão, servidor do Ministério da Saúde, sofreu para facilitar a negociação.

Prevaricação é quando um funcionário público deixa de agir ou retarda ação ao ser informado sobre alguma irregularidade para satisfazer interesses pessoais.

No caso da Covaxin, os investigadores vão apurar se Bolsonaro realmente foi informado sobre as suspeitas de irregularidades e se ele o presidente tomou alguma decisão caso realmente tivesse conhecimento do ocorrido.Rosa Weber, na autorização, determinou que os "autores do fato" sejam ouvidos. De acordo com o jornal O Globo, o entendimento da PGR é que Bolsonaro é uma das pessoas que devem ser ouvidas mesmo sem a citação nominal.

A compra da Covaxin despertou a atenção ao governo anunciar, em fevereiro, que compraria 20 milhões de doses da vacina por US$ 15 a dose, um montante de R$ 1,6 bilhão. Esse foi o imunizante mais caro contrato pelo governo e o único negociado por meio de intermediários.